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Méthodes de diagnostic

Les connaissances acquises par la recherche sur les bactéries ou virus phytopathogènes permettent de mettre au point des méthodes pour les détecter (dans la plante ou l'eau). Cette activité de mise au point est menée, sur la plate-forme de protection des plantes, en collaboration avec la station "Ravageurs et agents pathogènes tropicaux" du Laboratoire de la santé des végétaux, dont la mission est de produire et valider des méthodes nationales. Certaines de ces méthodes deviennent aussi parfois références européennes.

Tests de détection de bactéries phytopathogènes

Test de détection moléculaire de Xanthomonas axonopodis pv. dieffenbachiae

  • Brevet français N°:  FR2848222.
  • Date de publication : 11/06/2004
  • Extension du brevet aux Pays-Bas en 2006.
  • Inventeurs : Isabelle Robène-Soustrade, Philippe Laurent et Lionel Gagnevin.
  • Demandeur : Cirad
  • Usage d'une séquence d'ADN, présente chez toutes les souches de Xanthomonas axonopodis pv. dieffenbachiae pathogènes pour l'anthurium, comme sondes moléculaires pour la détection de cette bactérie responsable du dépérissement de l'anthurium.
  • Applications : diagnostic, contrôle, certification des anthuriums à l'importation, en pépinières,...
  • Méthode de référence européenne préconisée par l' OEPP .

Test de détection moléculaire de Ralstonia solanacearum (race 3, biovar 2)

  • Brevet international N°:  WO/2009/043937
  • Date de publication : 09/04/2009
  • Inventeurs : Christian Boucher, Mounira Elbaz, Stéphane Genin, Alice Guidot, Philippe Prior 
  • Demandeur : Inra
  • Usage de 49 séquences génomiques comme sondes moléculaires pour la détection de Ralstonia solanacearum (race 3, biovar 2), bactérie responsable de flétrissement, dans des échantillons de plantes (pomme de terre, tomate, géranium) ou les eaux d'irrigation. 
  • Applications : diagnostic, contrôle, certification de géraniums (Pelargonium spp.) et de Solanacées à l'importation, en pépinières,...

Test de détection moléculaire de Xanthomonas axonopodis pv. allii

  • Brevet déposé en France le 21/10/2009
  • Extension PCT déposée le 21/10/2010.

Test de détection de plusieurs phytopathogènes

Test de détection moléculaire de 7 pathogènes de la pomme de terre

  • PCR Multiplex détectant 7 organismes de quarantaine : les bactéries Ralstonia solanacearum (Rs), Clavibacter michiganensis ssp. sepedonicus et les virus PVX, PVY, PVS, PVA et PLRV : en cours de mise au point.

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